یک نماینده مجلس مصر می‌گوید: روزنامه نیویورک تایمز «وارد جنگ بر علیه مردم مصر شده است» و هم‌زمان دادستان عمومی این کشور خواهان تحقیقات جنایی در مورد انتشار یک خبر در مورد دولت مصر در این روزنامه شده است.
به گفته‌ی‌ روزنامه نیویورک تایمز، مصطفی الگندی، این روزنامه را متهم کرده است که «در تلاش است تا مردم، دولت و رئیس‌جمهوری مصر را سرنگون کند».

این اتهامات پس از آن صورت می‌گیرد که نبیل صادق دادستان کل مصر خواهان تحقیقاتی در مورد یک مقاله منتشرشده در نیویورک تایمز در روز 6 ژانویه شده است. در این مقاله از یک افسر اطلاعاتی مصر نقل‌قول شده که مقامات دولت مصر به مجریان برنامه‌های تلویزیونی گفته‌اند در سخنان خود مردم مصر را به قبول تصمیم آمریکا در به رسمیت شناختن اورشلیم به‌عنوان پایتخت اسرائیل تشویق کنند.
به گزارش روزنامه الاهرام مصر، نبیل صادق گفته است: «گزارش روزنامه نیویورک تایمز به دنبال تضعیف امنیت مصر و بر هم زدن صلح و آرامش عمومی و ضربه زدن به منافع کشور می‌باشد.»
موضع دولت مصر به صورت رسمی شناسایی یک کشور فلسطینی در چهارچوب مرزهای پیش از جنگ 6 روزه سال 1967 و اروشلیم شرقی به‌عنوان پایتخت آن است.
کشورهای عرب و مسلمان، ازجمله مصر، تصمیم دونالد ترامپ را خلاف صلح و امنیت خاورمیانه خوانده‌اند.
مایکل اسلکمن، دبیر امور بین‌المللی در روزنامه نیویورک تایمز، ضمن دفاع از انتشار مقاله مزبور گفته است: «این روزنامه هیچ قصد پنهانی بر علیه دولت و مردم مصر ندارد.»
وی اضافه کرده است: «خبر منتشره در روزنامه ما کاملاً حرفه‌ای و پس از تحقیقات ژورنالیستی دقیق منتشر شده است.»