دو روز پس از حملات مرگبار مهاجمان مسلح به مجلس شورای اسلامی و آرامگاه آیت‌الله خمینی، رهبر جمهوری اسلامی در پیامی به خانواده قربانیان تسلیت گفت.

آیت‌الله خامنه‌ای در پیام روز جمعه، ۱۹ خرداد خود حملات روز چهارشنبه تهران را نشانه آشکاری از کینه و دشمنی خباثت‌آلود مزدوران استکبار با مردم ایران، جمهوری اسلامی و رهبرهای فعلی و سابق آن دانست.

او بار دیگر تأکید کرد که این‌گونه جنایات کوچک‌تر از آن است که در عزم ملت ایران خللی ایجاد کند. رهبر جمهوری اسلامی در پیام خود کشته‌شدن شماری از شهروندان در این حادثه تروریستی را به خانواده‌های آنان تبریک و تسلیت گفته و تأکید کرده است که ملت ایران، متحد و با عزم راسخ به پیش خواهد رفت.
عدم صدور پیام به‌ هنگام و اعلام نشدن عزای عمومی از سوی حاکمیت به مناسبت حادثه مرگبار روز چهارشنبه تهران، انتقادات زیادی را به‌دنبال داشت. عصر روز چهارشنبه، ۱۷ خردادماه، آیت‌الله خامنه‌ای در دیدار با جمعی از دانشجویان حمله همزمان به مجلس شورای اسلامی و آرامگاه آیت‌الله خمینی را «ترقه بازی» خواند که انتقادهای زیادی در پی داشت.